基因编辑学术研讨会 -2017年3月 上海
演讲嘉宾

赵庆顺


南京大学  

赵庆顺

会议报告摘要:结构向导的核酸内切酶:一种新的基因组编辑工具

基因组编辑是新近发展起来的遗传工程方法,通过使用工程核酸内切酶或称“分子剪刀”在有机体的基因组中插入、删除或者替换DNA。2008年,利用锌指核酸酶(ZFN)技术成功实现了针对斑马鱼基因组的靶向突变,2011年ZFN技术被相对方便易行的转录激活样效应因子核酸酶(TALEN)技术所替代,而2013年出现的CRISPR技术因为其更为简单和高效、且没有物种限制而迅速风靡全球。但已有的这些基因组编辑技术都是基于通过对DNA序列的特异识别来定位目标基因。在新近发表的研究中,我们初步研发了一个基于DNA结构识别的新型基因组编辑技术即SGN技术。SGN由识别3’ 襟翼结构的襟翼核酸内切酶(FEN-1)和核酸内切酶FokI的DNA切割结构域(Fn1)融合形成。FEN-1负责识别由向导寡脱氧核苷酸(gDNA)与目标基因序列之间形成的3’ 襟翼结构,Fn1负责DNA链的切割。体外实验结果表明,SGN不仅可以切割单链DNA,也可以切割双链DNA。以斑马鱼胚胎为实验对象的研究表明,在一对gDNA的引导下,SGN可以切割斑马鱼基因组中的内源性基因,实现基因组编辑。

研究方向

斑马鱼发育生物学

生物360精选了赵庆顺教授在2015-2016年发表的3篇文章,翻译摘要以供读者更好的了解其工作成果,详情访问

   

研究经历

1987年本科毕业于南京大学,获学士学位;
1990年硕士研究生毕业于南京大学,获硕士学位;
1990-1996年任教于南京大学。
2001年博士研究生毕业于普度大学,获博士学位。
2001-2003年在杜克大学医学中心从事博士后研究。
2002年受聘于南京大学,任副教授;
2006年晋升为教授,2007年聘为博导。


近期发表论文

  1. Shu Xu, Shasha Cao, Bingjie Zou, Yunyun Yue, Chun Gu, Xin Chen, Pei Wang, Xiaohua Dong, Zheng Xiang, Kai Li,Minsheng Zhu**, Qingshun Zhao**, Guohua Zhou*. (2016) An alternative novel tool for DNA editing without target sequence limitation: the structure-guided nuclease. Genome Biology. 17(1):186.
  2. Jingyun Li, Yunyun Yue, Xiaohua Dong, Wenshuang Jia, Kui Li, Dong Liang, Zhangji Dong, Xiaoxiao Wang, Xiaoxi Nan, Qinxin Zhang, Qingshun Zhao*. 2015. Zebrafish foxc1a plays a crucial role in early somitogenesis by restricting the expression of aldh1a2 directly. The Journal of Biological Chemistry, 290(16):10216-28.
  3. Zhangji Dong, Xiaohua Dong, Wenshang Jia, Shasha Cao,Qingshun Zhao*. 2014. Improving the efficiency for generation of genome-edited zebrafish by labelling primordial germ cells. The International Journal of Biochemistry & Cell Biology, 55:329-34.
  4. Zhangji Dong, Jiachun Ge, Zhiqiang Xu, Xiaohua Dong, Shasha Cao, Jianlin Pan, Qingshun Zhao*. 2014. Generation of myostatin b knock out yellow catfish (Tachysurus fulvidraco) using transcription activator-like effector nucleases. Zebrafish, 11(3):265-74.
  5. Zhangji Dong, Jiachun Ge, Kui Li, Zhiqiang Xu, Dong Liang, Jingyun Li, Junbo Li, Wenshuang Jia, Yuehau Li, Xiaohua Dong, Shasha Cao, Xiaoxiao Wang, Jianlin Pan, Qingshun Zhao*. 2011. Heritable targeted inactivation of myostatin gene in yellow catfish (Pelteobagrus fulvidraco) using engineered zinc finger nucleases. PLoS ONE, 6(12):e28897.