魏文胜

“基因组编辑技术是革命性技术、革命性机会”

作为国内基因编辑领域的领军人物之一,魏文胜致力于真核基因修饰技术(TALE&CRISPR系统)及高通量功能基因组学的研究。从2014年结合高通量深度测序技术,找到了CRISPR功能性筛选的新方法,到2016年通过设计线性片段来提高基因敲除的效率,魏文胜带领其课题组不断地在这把“魔剪”的中靶和脱靶效应中探索着平衡。

生物360精选了魏文胜教授在2016年发表的2篇文章,翻译摘要以供读者更好的了解其工作成果。由于编辑个人翻译水平有限,如有错误感谢您的指正。

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Zhou Y, Zhang H and Wei W*. (2016) Simultaneous generation of multi-gene knockouts in human cells. FEBS Letters DOI:10.1002/1873-3468.12469.(注:开源paper可下载)

人类细胞中同时实现多基因敲除

摘要:
基因编辑技术使得基因敲除能够在各种哺乳动物细胞系中发生。然而,目前使用标准的方法来完全敲除一个目标基因的编码表达,基因编辑技术存在者技术性挑战的。为了提高产生可靠的基因修饰效率,我们使用包含报告基因的一个线性供体片段来设计方法。与同源独立重组基因敲入策略相结合,我们成功地丰富了携带靶标基因突变体的细胞内复制。当使用这个特殊的方法外加CRISPR/Cas9技术产生单一或者多基因敲除时,我们观察到这一敲除的成功率大幅提高。这个新方案为基因及其功能的分子生物学研究提供了强有力的新思路。

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Zhu S, Li W, Liu J, Chen C-H, Liao Q, Xu P, Xu H, Xiao T, Cao Z, Peng J, Yuan P, Brown M, Liu X* & Wei W*. (2016) Genome-scale deletion screening of human long non-coding RNAs using a paired-guide RNA CRISPR library. Nat Biotechnol doi:10.1038/nbt.3715.(注:开源paper可下载)

配对RNA(pgRNA) CRISPR数据库对人类lncRNAs进行大规模基因组缺失筛选

摘要:
CRISPR-Cas9技术筛选已经被广泛的适用于分析编码基因功能,但是使用这个方法对非编码区的高通量筛选是更具挑战性的。因为由在非编码区单切引起的基因的缺失和插入是不太可能产生功能性的敲除的。对产生非编码区DNA缺失高通量方法的研究是需要的。我们报道了一个对功能性非编码RNAs(lncRNAs)的筛选的高通量敲除策略,这个策略基于一个慢病毒配对RNA (pgRNA)数据库。应用我们的筛选方法,我们已经鉴定出51个lncRNAs,这些能过积极地或者消极地调控人类癌细胞的生长。我们经过使用CRISPR-Cas9介导基因缺失、功能性拯救、CRISPR的激活和抑制以及基因表达谱验证了这51个lncRNAs中有9个能够积极的调控人类癌细胞的生长。我们的高通量筛选pgRNA基因缺失的方法将能够使我们快速的辨别哺乳动物功能性的非编码因子。

如您对魏文胜教授的研究非常关注,请您关注即将在2017年3月24、25日在上海举办的“基因编辑专题研讨会”。魏文胜教授将在会议上就他的研究同各位做深入探讨。

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