演讲嘉宾--苏晓东

苏晓东
苏晓东
xdsu@pku.edu.cn
http://biopic.pku.edu.cn/detail.aspx?id=6
北京大学生命科学学院长江特聘教授 北京大学生物动态光学成像中心(BIOPIC)研究员、常务副主任; 国家杰出青年科学基金获得者。
研究学习经历:

1985年本科毕业于北京大学物理学院;1985-87年研究生就读于北京大学医学部生物物理教研室;1987年起在瑞典皇家Karolinska医学院细胞与分子生物学系攻读博士学位(1994年获得Ph.D.),1995-98在美国加州理工学院生物学部Howard Hughes 医学研究所 (HHMI)作博士后研究工作;1998年至2002年在瑞典LUND大学化学中心、分子生物物理学系先后担任助理教授、副教授。2003年作为长江特聘教授任教于北京大学至今。

主要研究领域为结构生物学、生物化学及分子生物学、单分子生物物理、新一代基因组测序技术、基于结构的药物及疫苗合理化设计等

近期发表论文:
  1. Gao R, Yu K, Nie J, Lian T, Jin J, Liljas A, Su XD. “Deep sequencing reveals global patterns of mRNA recruitment during translation initiation.” Sci Rep. 2016 Jul 27;6:30170. doi: 10.1038/srep30170.
  2. Jin J, Lian T, Gu C, Yu K, Gao YQ, Su XD “The effects of cytosine methylation on general transcription factors”. Sci Rep. 2016 Jul 7;6:29119. doi: 10.1038/srep29119.
  3. Xiao-Jun Wang, Qin Cao, Yan Zhang and Xiao-Dong Su* “Activation and Regulation of Caspase-6 and Its Role in Neurodegenerative Diseases” (2015) Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 55:553-72. doi: 10.1146/annurev-pharmtox-010814-124414.
  4. Chen HM, Yu K, Tang XY, Bao ZS, Jiang T, Fan XL, Chen XW, Su XD. Enhanced expression and phosphorylation of the MET oncoprotein by glioma-specific PTPRZ1-MET fusions.” FEBS Lett. 2015 Jun 4;589(13):1437-43. doi: 10.1016/j.febslet.2015.04.032.
  5. Gao J, Tao J, Liang W, Zhao M, Du X, Cui S, Duan H, Kan B, Su X*, Jiang Z.* Identification and characterization of phosphodiesterases that specifically degrade 3'3'-cyclic GMP-AMP. Cell Res. 2015 May;25(5):539-50. doi: 10.1038/cr.2015.40. Epub 2015 Apr 3.
  6. Heng Zhang1, Ming-Jie Han1, Jian-Li Tao1, Zhao-Yang Ye, Xiao-Xia Du, Ming-Jing Deng, Xiao-Yan Zhang, Lan-Fen Li, Zheng-Fan Jiang* and Xiao-Dong Su* “Rat and human STINGs profile similarly towards anticancer/antiviral compounds” Scientific Reports (2015)5:18035. doi: 10.1038/srep18035.
  7. Bao ZS, Chen HM, Yang MY, Zhang CB, Yu K, Ye WL, Hu BQ, Yan W, Zhang W, Akers J, Ramakrishnan V, Li J, Carter B, Liu YW, Hu HM, Wang Z, Li MY, Yao K, Qiu XG, Kang CS, You YP, Fan XL, Li RQ, Su XD*, Chen CC*, Jiang T.* “RNA-Seq of 272 gliomas revealed a novel, recurrent PTPRZ-MET fusion transcript in secondary glioblastomas” (2014) Genome Research 2014 Nov;24(11):1765-73.
  8. Jin, Jian-shi; Lian, Teng-fei; Xie, Xiaoliang, Xiao-Dong Su* “Single molecule studies of the interaction between the nucleosomal glucocorticoid response element and the glucocorticoid receptor” (2014) J. Cell & Mol. Biol. 2014 Oct; 6(5):438-40. doi: 10.1093/jmcb/mju033. Epub 2014 Jul 17.
  9. Sangjin Kim, Erik Broströmer, Dong Xing, Jianshi Jin, Shasha Chong, Hao Ge, Siyuan Wang,  Gu C, Yang L, Gao YQ, Xiao-dong Su*, Yujie Sun* & X. Sunney Xie*  “Probing Allostery Through DNA” (2013) Science. 339 (6121):816-9. doi: 10.1126/science.1229223.
  10. Ni X, Zhuo M, Su Z, Duan J, Gao Y, Wang Z, Zong C, Bai H, Chapman A, Zhao J, Xu L, An T, Ma Q, Wang Y, Wu M, Sun Y, Wang S, Li Z, Yang X, Yong J, Su XD, Lu Y, Bai F*, Xie XS*, and Wang J*  “Reproducible Copy Number Variation Patterns among Single Circulating Tumor Cells of Lung Cance Patients”, (2013) PNAS 110 pp21083-21088.
会议报告摘要:
中国人群中脑胶质瘤(GBM)精准医学研究及转化(4月23日 11:15 - 11:40 am)

脑胶质瘤是大脑中最常见的恶性肿瘤,具有高侵袭性、高异质性、预后差、易复发等特点。近年来,国内外多个研究组对脑胶质瘤开展了各类基因组学研究,发展了数种脑胶质瘤分子分型方法,鉴定了多个与脑胶质瘤相关的变异事件,并有针对性地进行了药物设计。作为中国脑胶质瘤基因组图谱计划 (CGGA) 的一个组成部分,通过高通量测序技术,我们对319例涵盖WHO II-IV级和复发样本进行了转录组及近50例外显子组测序,通过生物信息学方法进行了多项分析解读,获得了该样本集的基因表达谱和基因融合图谱。从122个样本中检测到了300个基因融合事件。在这些融合基因中,FGFR3-TACC3、PTPRZ1-MET (ZM)和RNF213-SLC26A11在多位患者样本中存在,ZM融合基因为首次在肿瘤中发现,并且在国内病人中比较多发,在白人病人中还没有被发现的确切报道。本报告将进一步详细比较CGGA和TCGA数据分析的结果及差异,为基于不同遗传背景及突变方式人群的精准医学实践及脑胶质瘤个体化治疗打下基础。

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第四届肿瘤基础和转化医学前沿国际研讨会